Отвечает Есения Павлоцки, лингвист-морфолог, эксперт института филологии, массовой информации и психологии Новосибирского государственного педагогического университета.
Правильное написание — пертурбация. Ошибки в этом слове обычно две: пере вместо пер и труб вместо турб.
Ошибка с “пере” очень понятная: происхождение слова непрозрачное, но мы знаем, что слово передает значение какой-то перестановки, перемены. Поэтому есть ощущение, что приставке “пере” там самое место.
Ошибку с “труб” вместо “турб” тоже можно объяснить: звукокомплекс труб для речевого аппарата русскоговорящего человека гораздо удобнее, чем турб — это особенности нашей фонетической системы.
Слово пертурбация пришло к нам из лат. perturbatio. Это:
1. Внезапный переворот в чем-нибудь, нарушение нормального хода явления, события, вызывающее замешательство;
2. Изменение пути небесного тела под влиянием силы притяжения других тел (астрологический термин).
Сформировалось это слово так: per значит в течение, по, сквозь, через; а turbatio — замешательство, расстройство, беспорядок.
Итак, правильно: пертурбация.
Сиро́ты или си́роты — как правильно? 
Яслей или ясель — как правильно? 
Галоша или калоша – как правильно? 
Мебелированный или меблированный — как правильно? 
Вку́пе или вкупе́ — как правильно? 
