Андрей Александрович Фурсенко родился 17 июля 1949 года в Ленинграде. Окончил Ленинградский государственный университет им. Жданова. Доктор физико-математических наук.
С 1971 по 1991 год работал младшим научным сотрудником, заведующим лабораторией, заместителем директора по научной работе Физико-технического института им. Иоффе Академии наук СССР.
В 1991 стал вице-президентом АО «Центр перспективных технологий и разработок» в Петербурге.
С 1994 по 2001 занимал должность генерального директора Регионального фонда научно-технического развития Санкт-Петербурга.
С 2000 — председатель научного совета Фонда «Центр стратегических разработок "Северо-Запад"».
2001-2002 — заместитель, а с июня 2002 — первый заместитель министра промышленности, науки и технологий Российской Федерации.
В марте 2004 года назначен министром образования и науки. Сохранил своё место при вступлении Владимира Путина на пост президента.
