Ученые химического факультета МГУ разработали аналитическую схему, которая позволяет делать заключения о процессах, протекающих в организме, с помощью химических «отпечатков пальцев». Результаты исследования опубликованы в журнале Analytical Methods.
Метаболом представляет собой совокупность низкомолекулярных соединений, в частности, углеводов, аминокислот, нуклеотидов и других органических молекул. Отмечается, что знание состава метаболома необходимо для динамического анализа процессов, происходящих в человеческом организме. Так, например, при развитии заболевания метаболом пораженной ткани может заметно изменяться, о чем будут свидетельствовать концентрации ряда веществ.
Кроме того, метаболомика помогает в поиске новых лекарственных средств, в микробиологии, пищевой химии, а также мониторинге состояния окружающей среды. При этом в метаболомике до сих пор отсутствует единая процедура анализа данных.
В связи с этим химики из Московского университета предложили универсальную рабочую схему анализа метаболома, основанную на сборе существующих статистических методик. Так, ученые собрали несколько десятков наборов экспериментальных данных из открытых репозиториев.
Разработанная сотрудниками МГУ методика включает в себя комбинацию мощных методов машинного обучения, статистического анализа и коррекцию дрейфа сигнала приборов, что позволяет решать задачи классификации, а также выделять минимально необходимый для правильной классификации набор биомаркеров. Стоит добавить, что все вычисления выполнены в одной программе и на одном языке программирования.