Из посольства РФ в Праге за неделю были высланы 35 дипломатов и 46 технических сотрудников. Парализована и работа чешской дипмиссии в Москве: после высылки там осталось всего 5 дипломатов, которым придётся самим себя обслуживать, – гражданам РФ запретили работать в чешском посольстве. 25 апреля президент Чехии Милош Земан решил немного пригасить конфликт. Он заявил, что у Праги нет доказательств, что агенты Петров и Боширов были на складе в Врбетице перед взрывом, а версию о причастности РФ могли разыграть иностранные спецслужбы.
Как считает доцент кафедры политической теории МГИМО Кирилл Коктыш, чехи не хотели бы доводить дело до санкций, а речь уже зашла о запрете на ввоз в РФ чешского пива. Но отмотать всё назад будет сложно. «После столь жёстких обвинений Москва явно желает услышать извинения Праги. В такие извинения верится с трудом – для чешских властей это означало бы потерять лицо перед внутренней аудиторией. К тому же чешская пресса так нагнетала антироссийскую истерию, что её градус зашкаливает. Теперь либо чехи предпочтут заморозить конфликт, либо пойдут до конца и потребуют от стран ЕС поддержать их новыми мерами против РФ».