Президент РФ Владимир Путин назначил Эдуарда Кабурнеева первым заместителем председателя Следственного комитета РФ. Указ опубликован на официальном портале правовой информации.
В апреле указом президента Кабурнеев занял пост зампредседателя СКР. В его обязанности входило курирование деятельности ГСУ СК России и Главного следственного управления по расследованию особо важных дел.
С 2017 года Кабурнеев руководил Главным следственным управлением СК России. До этого он возглавлял следственное управление СК РФ по Республике Дагестан.